排污权有偿使用费实行专款专用，除了用于排污权交易平台建设及运行维护、排污权指标核定工作及排污权交易技术应用研究外，还将重点用于排污权储备资金、主要污染物排放总量检测监控技术研究和设施建设、污染减排工程建设、重点污染源治理及生态环境保护等方面。据悉，环保部门今年还将开发排污权交易二级市场，为企业出让、申购和受让排污权指标搭建平台。从去年12月1日起，舟山市实行《舟山市主要污染物排污权有偿使用和交易管理办法（试行）》，并率先在新建项目和已通过环评审批且签署过参与有偿使用承诺书的企业中开展该项工作。截至目前，市环保局向近20家企业发出了缴款通知单，其中，路易达孚中奥能源有限责任公司等6家企业已购得排污权。

2013年1月29日路易达孚中奥能源有限责任公司等舟山市首批执行排污权有偿使用的6家企业在市环保局进行集中缴费，总金额超过900万元，这标志舟山市排污权有偿使用工作取得实质性进展。